小昭寺是汉语称谓。小，是与大昭寺相对应而言;昭，是藏语“觉卧”的音译，意思是佛。寺内供有释迦牟尼八岁等身像及众多的佛像和唐卡等。1962年被列为西藏自治区重点文物保护单位。
小昭寺，占地面积约4000平方米。其前部为庭院，后部是神殿及其门楼、转经回廓等附属设施。门楼高三层：底层为宽敞的明廓。明廓有10根大柱(直径0。8米)，皆为十六棱形。柱身有三条铜箍，铜箍面上透雕花瓣。柱一上半部雕有繁缛的花草纹，柱头上浮雕宝珠、“回”字纹、花瓣及连续 小昭寺的“六字真言”。前四排大柱的柱栱上浮雕海水云龙纹。明廓后部墙壁上绘有四大金刚(即四大天王)和六道轮回图(画面上有一个棕色的凶恶明王抱着一个巨大的车轮，巨齿獠牙衔着轮的上部;大轮分成三层，圆心画蛇、鸠、猪等，内轮分为六格，即六道，最外层又有十二个画面，称“十十缘起支”：即无明、行、识、名色、六处、触、受、爱、取、有、生、老死)、极乐世界图等壁画;门楼二三层是僧房和经堂等。穿过门楼即是绕神殿一周的转经回廊。回廊南、西、北三面原竖有木制嘛呢轮，廓壁上也遍绘无量寿佛、白度母等壁画。
小昭寺创建于公元七世纪中叶，香火延绵已逾千年。根据五世达赖喇嘛所著的《大昭寺目录》等书记载：小昭寺主神殿原来主供文成公主从长安带来的释迦牟尼12岁等身像，大昭寺主神殿原来主供尼泊尔的尺尊公主从加德满都带来的释迦牟尼8岁等身像。松赞干布逝世后，遵照文成公主的旨意，大昭寺和小昭寺释迦牟尼等身佛像进行了对换。
著名的拉萨上密院，也设在小昭寺内，这是格鲁派僧人研读佛经颇有成绩的喇嘛进一步深造、修习密乘的地方，上密院堪布兼任小昭寺主持。
小昭寺的名声和规模都比不上大昭寺，也没有那么热闹。但是别有特色。
2001年06月25日，小昭寺作为公元641年的古建筑，被国务院批准列入第五批全国重点文物保护单位名单。
小昭寺历史上几经火焚，现存的小昭寺的建筑大多是后来重修的，只有底层神殿是早期的建筑，殿内的10根柱子依稀可见吐蕃遗风：上面镂刻着莲花，并雕有花草、卷云以及珠宝、六字真言。小昭寺主楼三层，底层分门庭、经堂、佛殿三部分，周围是转经廊道，廊壁上遍绘无量寿佛像。顶层是汉式金瓦，金光闪闪，凌空摩天，拉萨各个方位均能看到，蔚为壮观。
小昭寺神殿高三层：底层分为门庭、经堂、佛殿三部分。门庭内左右为隔门小房，右间是放吹器的地方;左间是配殿，内供有石榴树枝做的贡布色懂马塑像。中间是四柱宽的空廓，传说原来其中一根柱上挂有文成公主手印的石板，另一根柱上挂有护法画皮两张。四柱皆为圆形大柱，大柱小栱两侧各雕一大力士，力士作承托支撑状。柱头大栱上雕有狮子和圆形升云纹、花瓶等。有的柱头小栱两则浮雕象征性的狮子和人像。门上铺首如钹形，上有二龙戏珠图案。横梁上皆写梵文六字真言。这些雕刻古朴端庄，体现了早期内格特征。门庭后面为经堂。经堂进深7间面阔3间，30柱，柱下皆有石柱础。其中中部4根大柱直通二层之上撑起高敞天窗。柱高6。2米，直径0。46米;其余26根柱子高2。8米，直径0。48米。柱头皆为卷云纹、宝珠、莲花纹等雕饰。集会堂天井正对的一排檩头上原雕有28只卧狮，现存27只，系全雕和半雕;腹腔上有底座，装饰四瓣或八瓣莲花。集会堂四壁曾遍绘释迦牟尼、千尊佛等。西后净室门口南面供塑有舍利弗与目犍连两大弟子孙灵塔及高0。4米的铜鎏金密集金刚造像、泥塑的杰尊·贡嘎顿珠造像;北面供有高1米的吉祥金刚怖和能仁佛、藏巴拉等佛像。
